Furono il cimitero ufficiale della Chiesa di Roma nel III secolo. In esse furono sepolti circa mezzo milione di cristiani, tra cui decine di martiri e sedici pontefici. Prendono il nome dal diacono San Callisto che, all’inizio del III secolo, fu preposto da Papa Zeffirino all’amministrazione del cimitero.
Il complesso callistiano è proprietà dell'A.P.S.A. - Amministrazione del Patrimonio della Sede Apostolica. Il governo, la custodia e la conservazione sono affidate alla P.C.A.S. - Pontificia Commissione di Archeologia Sacra, organismo della Santa Sede. Dal 1930 l'accoglienza dei pellegrini e la visita guidata alle catacombe aperte al pubblico sono affidate ai Salesiani di Don Bosco.